Adapun Struktur Organisasi Fakultas Keguruan Dan Ilmu Pendidikan Universitas Pattimura terdiri dari :
- Unsur Pimpinan Yang Meliputi :
- Dekan
- Wakil Dekan Bidang Akademik
- Wakil Dekan Bidang Umum, Keuangan, Perencanaan, Dan Sistem Informasi
- Wakil Dekan Bidang Kemahasiswaan Dan Alumni
- Senat Universitas Pattimura sebagai badan normatif dan badan perwakilan tertinggi di tingkat fakultas.
- Koordinator Program studi sebagai pelaksana akademik.
- Unsur pelaksana akademik :
- Kelompok Jabatan Fungsional Dosen
- Unsur pelaksana administrasi : Bagian Tata Usaha, yang meliputi:
- Kabag TU
- Sub Bagian Akademik
- Sub Bagian Umum dan Barang Milik Negara (BMN)
- Sub Bagian Kepegawaian dan Keuangan
- Sub Bagian Kemahasiswaan
